Библиотека Института мерзлотоведения СО РАН была создана в 1961 году. После расформирования Института мерзлотоведения им. В.А. Обручева в Москве (ИНМЕРО) Институту была передана часть библиотеки ИНМЕРО, которая составила основу книжного фонда библиотеки ИМЗ СО РАН.

Профиль комплектования — естественные науки, науки о Земле, технические науки. Учитывая уникальность тематики исследований института, и соответственно книжного фонда, библиотека получила в 1981 году статус филиала депозитария ГПНТБ СО РАН по теме мерзлотоведение.

Фонд библиотеки составляет 40213 ед. хранения. Из них книг – 16692 экз., журналов – 21245 экз., на русском и английском языках. Имеются редкие книги, изданные еще в девятнадцатом столетии, кроме того, фонд библиотеки включает карты, научные отчеты, диссертации.

С начала создания в библиотеке работали: К.Н. Большедворская (библиотекарь), Р.Н. Ушницкая (заведующая), М.И. Грогуленко (библиограф). Именно ими был создан справочно-библиографический аппарат библиотеки – алфавитный и систематический каталоги и библиографические картотеки, которыми до сих пор пользуются наши читатели.

С 2000 года ведется Электронный каталог библиотеки, который включает книжный каталог, каталог статей, научно-технических отчетов и авторефератов диссертаций, электронный каталог доступен читателям в читальном зале библиотеки.

В рамках национальной подписки получен доступ к ряду зарубежных электронных ресурсов: Wiley, Questel SAS, Springer Nature.

Заведующими библиотекой в разные годы работали:

• Большедворская Калерия Никитична
• Ушницкая Раиса Ивановна
• Геннадиник Галина Викторовна
• С 1989 года заведующая библиотекой Ившина Эльза Павловна.